Целями деятельности является управление, развитие рекреационного потенциала и обеспечение соблюдения режима охраны особо охраняемых природных территорий (далее — ООПТ) регионального значения, участие в ведении Красной книги  Краснодарского края, участие в организации и осуществлении региональных и межмуниципальных программ и проектов в области охраны окружающей среды и экологической безопасности.

Обеспечение режима особой охраны ООПТ регионального значения осуществляется тремя территориальными отделами. В обязанности отделов  входит проведение мероприятий  по  патрулированию и осмотру текущего состояния ООПТ находящихся в зоне их деятельности.

Экологическое просвещение, информирование населения об ООПТ регионального значения входит в функции отдела благоустройства и экологического просвещения. С целью реализации данной функции регулярно осуществляются мероприятия направленные на развитие и понимание в обществе бережного отношения к природе путем организации и проведения экологических  мероприятий в целях повышения  экологической культуры (экологические акции, праздники). Регулярно публикуются тематические материалы в средствах массовой информации. Систематически проводится работа с учащимися общеобразовательных школ в области экологического просвещения.

Разработанный интернет сайт ГКУ КК «Управление особо охраняемыми природными территориями Краснодарского края», функционирует. На нем публикуется и постоянно обновляется информация о работе структурных подразделений  учреждения, проведенных и планируемых мероприятиях по управлению и развитию ООПТ регионального значения.

Вместе с этим немаловажным мероприятием является обозначение на местности границ ООПТ и их функциональных зон, при котором  осуществляется установка на местности аншлагов и информационных стендов, содержащих информацию о границах и режиме охраны ООПТ.

Подготовкой аналитических отчетов о состоянии ООПТ и принятие своевременных мер по устранению выявленных нарушений режима ООПТ, участие в обеспечении населения информацией, осуществляет отдел обеспечения соблюдения режима охраны особо охраняемых природных территорий регионального значения.

Директор учреждения — должность вакантна.

Заместитель директора — Петерс Яков Яковлевич (исполняющий обязанности директора).

Заместитель директора — Квач Сергей Михайлович.

Начальник отдела организационно-правовой и кадровой работы — Слепых Яна Владимировна.

Главный бухгалтер — Панова Валентина Ивановна.

Начальник отдела благоустройства и экологического просвещения — Калайдина Людмила Владимировна.

Начальник отдела обеспечения функционирования особо охраняемых природных территорий — Свиридонов Николай Михайлович.